Mon travail de thèse

I have started my PhD in september 1998 at the LPM2C. We leave this lab for the CEA/DRFMC since may 1999. I am currently working with Professor B. Fourcade on the physical properties of biological system such as DNA and vesicle. Our main tool is the computer.

Until our articles are published I can not put any results on this web site.

J'ai commencé ma thèse en septembre 1998 au LPM2C avec le professeur B. FOURCADE. Nous nous sommes déplacés au CEA-Grenoble/DRFMC depuis le mois de mai 1999. Mon travail de thése porte sur l'études des propriétés physiques de bio systèmes tels l'ADN ou les vesicules. Cette étude se fait principalement par le biais des simulations numériques.

Tant que nous n'avons pas publié d'articles dans une revue scientifique, je ne peux pas publier de résultats sur mon site. Venez vérifier de temps en tant si de nouvelles informations sont disponibles.

Nous cherchons à mettre au point des simulations les plus réalistes possibles afin de décrire les systèmes étudiés. Nous ne faisons pas de dynamique moléculaire mais les approches de type Monte Carlo sont parfois utiles. En fait, il s'agit vraiment d'un travail d'expérimentation numérique. Les résultats de ces expériences informatiques nous permettent d'orienter nos choix pour obtenir des description analityques dans les cas limites.

Enfin, les programmes sont tous réalisés sur places selon les besoins. Evidemment, nous utilisons les librairies disponibles mais cela fait partie de mon travail d'écrire celles qui nous manquent ou d'adapter les autres. Dans la rubrique programmation, vous trouverez des liens vers certaines de mes librairies.

Références

Les quaternions sont un moyen très astucieux pour manipuler les rotations en trois dimensions.
Pour en savoir plus sur l'ADN, je vous conseil l'excellent livre (en anglais) de C.R. Calladine, H.R. Drew et M.J. McCall, Understanding DNA, the molecule and how it works chez Academic press (1997) (disponible chez amazon).
Evidemment, pour le calcul, "l'incontournable" Numerical Recipes, the art of scientific computing de W.H. Press, B.P. Flannery, S.A. Teukolsky et W.T. Vetterling chez Cambridge University Press.

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